Добрый день.
А что вы сделали в базе? Просто поменяли значения.
Нужно создать новое подразделение с реквизитами, перевести туда всех сотрудников и расчеты производить по подразделению с новым ОКТМО, отличным от организации.
При формировании отчета будет возможность отбора.